本手册主要介绍phred\phrap－基因组的序列装配软件包。Phred是phred\phrap软件包的一部分，主要是用来分析和装配基因组中大片段序列。phred\phrap软件包由华盛顿大学分子生物技术学院的Phil Green和Brent Ewing开发，主要用于学术科研活动。Phred能处理测序仪直接生成的色谱图，并且产生相关的信息。

该手册只对Phred 作简要的介绍， 并不能替代Phred 的官方说明文档（http:\\www.phred.org），给实际应用提供一个快速参考。