问题	原因	解决办法
DNA带模糊	DNA降解	避免核酸酶污染
	电泳缓冲液陈旧	电泳缓冲液多次使用后，离子强度降低，pH值上升，缓冲能力减弱，从而影响电泳效果。建议经常更换电泳缓冲液
	所用电泳条件不合适	电泳时电压不应超过20V/cm，温度＜30℃；巨大DNA链电泳， 温度应＜15℃；核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力
	DNA上样量过多	减少凝胶中DNA上样量
	DNA样含盐过高	电泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐
	有蛋白污染	电泳前酚抽提去除蛋白
	DNA变性	电泳前勿加热，用20mM NaCl缓冲液稀释DNA
不规则DNA带迁移	对于λ/Hind III片段cos位点复性	电泳前于65℃加热DNA 5分钟，然后在冰上冷却5分钟
	电泳条件不合适	电泳电压不超过20V/cm；温度＜30℃；经常更换电泳缓冲液
	DNA变性	以20mM NaCl Buffer稀释DNA，电泳前勿加热
带弱或无DNA带	DNA的上样量不够	增加DNA的上样量；聚丙烯酰胺凝胶电泳比琼脂糖电泳 灵敏度稍高，上样量可适当降低
	DNA降解	避免DNA的核酸酶污染
	DNA走出凝胶	缩短电泳时间，降低电压，增强凝胶浓度
	对于EB染色的DNA，所用光源不合适	应用短波长（254nm）的紫外光源
DNA带缺失	小DNA带走出凝胶	缩短电泳时间，降低电压，增强凝胶浓度
	分子大小相近的DNA带不易分辨	增加电泳时间，核准正确的凝胶浓度
	DNA 变性	电泳前请勿高温加热DNA链，以20mM NaCl Buffer稀释DNA
	DNA链巨大	常规凝胶电泳不合适   在脉冲凝胶电泳上分析