近20年来，随着捕捞船只和马力数不断增大，使中国沿岸和近海渔业资源受到严重影响。特别是被称为中国海洋四大渔业的大黄色、小黄鱼、带鱼和乌贼受威胁最大，它们的产量大幅度下降。

　　污染使海水富营养化，诱发赤潮的发生。中国沿海80年代曾发生赤潮221次，记录的赤潮生物达127种。赤潮发生时，鱼、虾、贝类大量死亡。严重污染的地段，如某些排污口的潮间带，有时甚至导致物种绝迹。

　　许多海洋工程的兴建也破坏了生物生境和生态系统。40多年来中国沿海围海造地、开垦滩涂总面积超过66万hm²，使原有野生物种丧失了大面积生境。

　　外来物种侵占了本地物种的生境，排挤本地物种。如引进多种藤壶、海鞘、多毛类、沙饰贝(Mytilopsis sallei)以及部分海岸的大米草等都不同程度地排斥本地物种。