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核酸基因分子探针-实验方法
来源:互联网 作者:未知 发布时间:2006-12-16
核酸基因分子探针-实验方法
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核酸基因分子探针
作者:佚名    实验频道来源:生物谷    点击数:    更新时间:2004-6-18

从化学和生物学的意义上理解,探针是一种已知特异性的分子,它带有合适的标记物供反应后检测。探针和靶的相互反应如抗原-抗体、血凝素-碳水化合物、亲合素-生物素、受体和配体,以及核酸与其互补核酸间的杂交等反应均属此类。用核酸探针与待检标本中核酸杂交,形成杂交体,再用呈色反应显示。此方法用于疾病的诊断,称为分子杂交基因诊断。此法开始用于遗传性疾病的诊断如血红蛋白病的诊断、先天性遗传病的产前诊断。近来,已发展为诊断外源性病原体如病毒、细菌、原虫等的方法;内源性病变基因研究如癌基因检测、基因突变、基因缺失或变异引起的疾病的基因诊断;人类基因识别及其生理功能和衰老有关研究;在法医检测中有关性别鉴别和DNA指纹谱的鉴定。基因探针的研究引起了人们高度重视,在探针的制备技术上有重大突破。可将核酸分子探针检测比喻为在柴草堆中去找一根针的神奇技术。据美国华尔街分析家预言:在生物技术市场中,下一个突破和具有吸引力的是基因探针。它的巨大的开发潜力和经济效益,已引起人们的重视。

目前基因检测方法中以同位素标记(32P35S等)DNA探针灵敏度最高,但由于放射性污染、半衰期短、需要特别的安全防护条件等,限制了同位素标记探针的广泛应用。因此,非同位素标记探针的研制引起重视,自Langer等(1981)合成了生物素化 dUTPNTP类似物以来,开创了用非同位素标记的新领域,用生物素标记核酸探针检测和识别特定的核酸序列,已广泛应用于临床检验和科学研究。Leary等(1983)用缺口平移法标记的生物素DNA探针成功地用于Southern印迹杂交技术。Forst等(1985)发表了光敏生物素直接标记核酸的简便方法,使核酸和蛋白质的生物素标记探针技术前进一大步。Renz等(1984)、Thorpe等(1985)和 Pollars Knight等(1990)用化学法直接把辣根过氧化物酶接到DNA上,运用发光显影法提高了敏感性。Muhlegger等(1990)用地高辛(Digoxigenin)标记DNA,再用地高辛抗体连接碱性磷酸酶,催化发光底物金刚烷脱磷并发光,灵敏度与32P标记探针相同,而且32P、标记的DNA探针杂交膜需要在-70℃件下曝光47天于X光片上显影,碱性磷酸酶发光法只需1030min,十分快速、简便。

基因诊断的被检测基因或目的基因存在于样品中,先将样品中核酸提取出来,或在原位,或将样品点在硝酸纤维素滤膜上,再经蛋白酶处理,或酶切成较小的片段,经变性处理(热或碱变性)成单链。另一方面制备已知核酸序列标记的核酸分子探针,也经变性成单链。根据核酸链之间碱基配对的原理,将此核酸探针与样品中核酸单链结合成双链核酸,即称分子杂交。被检样品形成杂交双链,显示阳性结果。如样品无与探针互补的序列,则不发生分子杂交,结果为阴性。这种技术用于诊断要依靠基因探针,可见基因探针是基因诊断中的关键性试剂。

核酸探针传统的标记物是用放射性同位素,多用32PdNTP3HdNTP35SdNTP等。用放射性同位素标记核酸有以下优点:

(1)         灵敏性高:一般可达到0.55pg或更低浓度核酸的检测水平,可以检测极少量或拷贝数少的基因组(可延长曝光时间或增敏屏增敏)。

(2)         特异性高:用放射自显影法,样品中存在的无关核酸或非核酸成分不会干扰检测结果,准确率高,假阳性率低。

(3)         方法简便。所以,放射性同位素标记核酸探针在一些有条件的单位,作为主要的标记方法仍在使用。

放射性同位素标记技术也存在以下缺点:

      半衰期短,必须经常标记探针:如32P、半衰期只有14.3天,放射强度逐日变化。35S的半衰期可达88天,但衰变能量只有32P1/10,灵敏度较低,只能用于多拷贝基因的检测。3H的半衰期虽长达12.26年,但衰变能低,灵敏度太低。

      费用高 α-32P标记的dATP400Ci/mmol),需要进口试剂,价格高。

      检测时间长:用放射自显影需要较长的曝光时间(115天)。

      放射性同位素对人体有害,实验室和环境易被污染,放射性废物处理困难。因此,推广使用受到限制。

所以研究非放射性标记核酸探针及其检测显示方法、为推广应用基因诊断创造有利的条件,已成为80年代以来各国十分重视的研究目标。这项技术属生物高技术中发展很快、前景很大的项目。美国科学家于1981年首先合成了生物素标记的脱氧尿嘧啶核苷三磷酸,他们采用缺口平移制成生物素化核酸探针,成功地用于探测一系列基因。随后美国的BRLEnzo biochem 生产了这种生物素标记探针及分子杂交成套试剂盒。1985年澳大利亚合成了光敏生物素,用于直接标记核酸,这是Adelaide大学Forest等学者的重大成功。该大学的Bresatec公司和美国的Vector实验室,先后完成了配套试剂盒。1988年西德Boehring

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