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实验题目:蔗糖酶的N-末端氨基酸测定 教 师:XXX
实验类型:基础 学 时:8(参考)
内 容:
一、实验目的 掌握FDNB法测定蛋白质N-末端氨基酸的原理和方法。
二、实验原理 FDNB与蛋白质在室温,pH=8.0—9.0条件下反应,生成DNP—蛋白;随之,在105℃,6mol/LHCl条件下水解,生成DNP—氨基酸及其它游离氨基酸。由于DNP—氨基酸溶于乙醚,而其余氨基酸不溶,故用乙醚抽提出DNP—氨基酸,再将未知样的DNP—氨基酸与已知标准DNP—氨基酸共同进行纸层析,根据Rf值即可推断未知样N末端为何种氨基酸。
三、试剂与器材 •锥形瓶•25—50ml分液漏斗•层析缸•离心机•黑纸•水解管•层析纸•毛细管 •离心管•培养皿(1)10%碳酸氢钠溶液(2)1mol/L氢氧化钠溶液(3)5%FDNB乙醇溶液 (4)浓盐酸(优级纯)(5)乙醚的处理: (6)乙醇(7)1.6mol/L, pH=6.0的磷酸盐缓冲液。(8)6 mol/L 盐酸
四、操作方法 DNP—蛋白的制备、DNP—蛋白水解、DNP—氨基酸的抽提、DNP—氨基酸的鉴定、计算迁移率Rf值
五、关键步骤与注意事项
1、由于反应期间有二氧化碳和氟化氢气体生成,因此,在振摇期间应间隔放气,以免反应液随气体冲出,腐蚀皮肤,且放气时管口不要对着别人。
2、反应过程中应注意溶液pH值的变化,使其保持在pH8.0-9.0,若低于此范围,应用1mol/L氢氧化钠溶液调整,注意pH值不可过高,若pH超过9,则易使FDNB分解成二硝基苯酚(DNP—OH)。
3、由于加入盐酸后,会有大量的二氧化碳气体产生,因此在加完每一滴盐酸,待反应产生的气体消除后,再加入第二滴,防止气泡冲出管外。
4、以下步骤,均取血红蛋白单独操作。※ 每次洗涤液不必太多,以免离心时冲出,只需将沉淀浸没即可。
5、最后一次醚洗涤后,弃去上清,不断搅拌沉淀直至黄色干粉状(此时可打开管上的胶布和黑纸)。此步一定要不断搅拌,使乙醚很快蒸发,否则DNP—蛋白会结成硬块,不易水解完全。
6、水解管封管时,应先将管内的冷空气赶尽,否则在烘箱内加热时会膨胀引起管炸裂。
7、水解时间的长短与蛋白质及其N—末端氨基酸的种类不同而异。
8、水的用量不宜过多,以免DNP—丝氨酸或DNP—苏氨酸部分溶于水层,造成损失,醚层中含有醚溶性DNP—氨基酸。
9、DNP—组基酸和DNP—精基酸是水溶性的,不能被乙醚抽提,而留在水相。若怀疑蛋白或肽的N—末端氨基酸是组氨酸或精氨酸时,则应将水层在60℃水浴上蒸干,再加入1ml蒸馏水,蒸干,反复两次以除去盐酸,再进行鉴定。
10、点样时不能太靠纸的边缘,以免溶剂效应,使点扩散,样品相隔也不要太近,以免互相重叠,丙酮加入量不要太多,以免浓度太低,走出的斑点颜色淡,但浓度过大,则易形成拖尾。
六、思考题
1、分析和鉴定 DNP—氨基酸采用什么方法?为什么采用此方法?
2、盐酸、乙醚、乙醇及水洗的作用是什么?
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